.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
Gästskådespelare
Dr. Zelenka - David Nykl, Dr. Peter Grodin - Craig Veroni, Sergeant Bates - Dean Marshall
Story: Martin Gero, Regissör: Mario Azzopardi, Produktions. NR: 1x13

Nu när stormen som inträffar var 20 år äntligen är över, är den byggnadsintegriteten i dom tidigare översvämmade (och ännu inte utforskade) områdena i Atlants i stort behov av att gås igenom noggrant. Dr. Rodney McKay leder dessa inspektionsteam, bestående av ett dussintal forskare. I hans grupp ingår Löjtnant Aiden Ford och Drs. Zelenka och Hays, Atlantis bedöms som säker. McKay anropar Dr. Weir, och ger henne dom goda nyheterna och är på väg att avsluta uppgiften när man upptäcker att två ur gruppen saknas. Dom som saknas är Wagner och Johnson, Ford, McKay och Zelenka hittar dem i en mörk korridor:
Wagner ligger på mage död, och has partner Johnson. Befinner sig ett paniktillstånd, skrikande om ickemänskliga väsen som finns "överallt". Sen dör även hon.
McKay informerar Weir att han har en karantänsituation och behöver få dit ett inneslutningsteam, omedelbart. Folk kan inte bara se saker för att sedan falla ihop döda; Wagner och Johnson måste ha blivit utsatta för någonting, och det är ganska troligt att även McKay och dom andra också är smittade.
Weir informeras av Dr. Grodin, som råder henne att införa en självreglerad karantän över hela staden. Weir talar till invånarna, där hon säger åt dem att alla måste stanna där dom befinner sig tills detta hot försvunnit. Major John Sheppard och Teyla befinner sig i träningslokalen, där dom övat strid med käppar. Sheppard har haft sin radio avslagen, och dom har precis hört talas om nödläget genom Weirs meddelande. Sheppard tar kontakt med Weir, som beordrar honom att stanna där han är.
McKay går tillbaka med sitt folk för att kunna ta reda på var Johnson och Wagner, hade gjort sina undersökningar. Det verkar som om dom stött på ett av Dom Gamlas viruslabb, och ett par behållare hade gått sönder. Plötsligt börjar en i gruppen, Dumais, att skrika att hon ser "varelser," sen grabbar hon tag i sitt huvud och dör. Peterson en av stadens tekniker, säger då att han sett dessa varelser ett tag nu, straxt därefter springer han iväg i panik. Han försök ta sig upp till dom övre nivåerna i stan.
Sheppard och Teyla trotsar Weirs order, och beger sig till Becketts läkarmottagning där dom sätter på sig skyddsdräkter för att kunna ge sig ut efter Peterson. Dom hittar honom men han flippar ut, och springer in i en av stadens transportörer. Han kommer sedan ut i mässen, där han kort därefter dör. Staden stängs automatiskt, där bland annat kontrollrummet stängs ute från resten av staden. Grodin antar att Atlantis har upptäckt viruset och stängt ner sig självt. Den stängde aldrig ner dom lägre nivåerna där virusets släppts lös, eftersom översvämningen måste ha skadat spårsystemen där. Dörrar öppnas och transportörerna fungerar för Shepard och Teyla, eftersom dom har på sig skyddsdräkter och inte ses som ett hot.
Nere i viruslabbet undersöker Beckett, McKay och Hays som är nästa att dö. Och enligt McKays uträkningar angående viruset, så har detta en inkubationstid på 6 timmar. Obduktionerna visar att alla som infekterats dött på grund av en brusten aneurysm, precis ovanför hjärnbark. Viruset verkar ha designats till att få folk att se spöklika varelser, och göra dem galna och sedan döda dem. Tiden har tagit slut för Hays, han blir plötsligt galen och dör. Näste man är McKay, men ingenting händer. Varför? På grund av att han har De Gamlas gen.
McKay upptäcker sen att det dom har att göra med, är ett nanovirus — mikroskopiska maskiner som programmerats till att döda människor. Endast 48 procent av Atlantis' befolkning kan för närvarande acceptera denna gen, så genterapi för alla är inte något val. McKay säger till Sheppard att gå till hans labb för att aktivera en liten elektromagnetisk pulsgenerator, hans teori är att detta kommer att förinta naniterna. Men generatorn är för liten. Viruset är fortfarande vid liv, vilket bevisas av att Atlantis fortfarande är under högsta skyddslarm.
Vad man behöver är en kraftigare puls, med McKay och Weirs godkännande tar Sheppard med sig en Naquadahgenerator i en Pölhoppare, och spränger den högt ovanför staden. Atlantis' system startas åter upp automatiskt. Och nanoviruset är utrotat.
Eftersom Wraith endast får sin föda från människor, blir dom avfärdade för att ha skapat ett virus som dödar dem. Detta lämnar en skrämmande fråga: Vem har skapat det? …
Kände ni till att?
Atlantis' datasystem arbetar på ett helt annat sätt än datorer på Jorden, som
ett resultat är dessa inte lika känsliga. Som exempel, en elektromagnetisk puls
som skulle förstöra alla datorer och elektronik på Jorden skulle inte ens orsaka
ett flimmer på Atlantis.
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................



